浙大亚欧实行董事会领导下的院长负责制度，董事长武彬教授，院长林正秋教授。组织机构主要由总部与战略经营单元构成，设置如下：

　　浙大亚欧总部 ,包括院长办公室、总师办公室、市场拓展部及专家顾问委员会。

　　根据市场及可持续发展原理，以做大做强及提供多种利润来源为目标，浙大亚欧的战略经营单元划分如下：

　　浙大亚欧旅游规划设计所、浙大亚欧环境景观设计所、浙大亚欧风景建筑设计所、浙大亚欧城市规划设计所、浙大亚欧数字三维动画设计所及中国旅游规划网等（参见浙大亚欧组织机构图）。

　　浙大亚欧一总部六个事业部，从组织上充分保障了全能型的人才队伍的建设，从而可以最大限度地节约业主方的交易成本，使“一揽子”、“交钥匙”工程成为国内独一无二的、我院特有的专业技能。正因为如此，我院在旅游规划设计市场上，综合竞争力强，品牌形象佳。